南京地理与湖泊研究所位于南京市风景秀美的玄武湖畔、紫金山麓，是中国科学院知识创新工程单位，其前身为成立于1940年的中国地理研究所，历经70多年的发展，现已成为全国唯一以湖泊-流域系统为研究对象的综合研究机构，主导着中国湖泊科学的发展方向，并在国际上具有重要影响，在湖泊物理、湖泊化学、湖泊生物、湖泊沉积与全球变化以及区域可持续发展等领域形成了鲜明的学科特色和研究优势。
南京地理与湖泊研究所围绕国家重大战略需求，结合研究所发展定位和学科布局，在湖泊治理与保护方面建议并承担了一系列重大科研项目，致力于建设成为学科综合优势显著、地域特色鲜明、国家知识创新体系中不可替代的国际著名湖泊科学综合研究和高层次人才培养基地，国家湖泊资源利用与环境治理工程技术研究中心，以及经济发达地区可持续发展科学研究与决策咨询中心。
中科院遥感地球所是在中国科学院遥感应用研究所、中国科学院对地观测与数字地球科学中心基础上组建的直属于中国科学院的综合性科研机构，设置科技机构、管理机构、支撑机构、咨询机构等，其中遥感科学国家重点实验室、对地观测应用技术中心、国家遥感应用工程技术研究中心、中科院数字地球重点实验室、中国遥感卫星地面站、中科院航空遥感中心是科研与运行工作的主体。
中科院遥感地球所拥有联合国教科文组织、科技部、发改委等机构设立的空间技术中心、国家工程实验室、工程技术中心、陆地卫星数据中心等科研平台与基地，致力于研究遥感信息机理、对地观测与空间地球信息前沿理论，建设运行国家航天航空对地观测重大科技基础设施与天空地一体化技术体系，构建形成数字地球科学平台和全球环境与资源空间信息保障能力。
敦煌研究院是集保护、研究多种业务于一体的综合性研究机构，其前身是成立于1944年的敦煌艺术研究所，现为敦煌学研究的科研单位，以及保护敦煌石窟（莫高窟、榆林窟、西千佛洞）和其它文物的文博单位，也是爱国主义教育基地和旅游接待单位。研究院遵循“保护、研究、弘扬”的工作方针，在敦煌石窟的保护和研究、敦煌艺术和敦煌文献研究、敦煌文化弘扬等方面都有辉煌的业绩。
敦煌研究院现设有保护研究所、美术研究所、考古研究所、文献研究所、资料中心、摄录部、陈列中心、敦煌藏经洞陈列馆、接待部、保卫处、学术委员会、办公室、人事处、党委办公室等机构。
中科院人事局是中国科学院的人事管理机构，主要负责人力资源规划、政策、规章制度等的研究制定，领导干部队伍建设与管理，各类人才计划、博士后等综合管理，机构设置、事业编制与岗位配置管理，薪酬、激励、保障等人事管理，职工继续教育与培训工作，院机关人事管理等，对口联系国家有关部门，承担院领导交办的工作。
中科院人事局目前设置有综合处、领导干部处、人才处、机构与岗位管理处、薪酬与社会保障处、继续教育与干部监督处、机关人事处(机关党委办公室)等机构。
信息研究院是直属于国家安全生产监督管理总局的国家级科研机构，也是集信息研究、图书音像出版、物业开发三大支柱产业于一体，具有较强基础和实力的研发机构，主要以安全生产、煤炭、能源、环境、科技和法律等领域信息研究为核心，致力于为全国安全生产和煤炭行业发展提供重要的信息支撑、决策咨询和技术研发服务。
信息研究院作为全国安全生产和煤炭工业文献中心，致力于安全生产和煤炭技术推广和科学普及、出版《中国安全生产》《中国煤炭》《当代矿工》《中国煤层气》《安全生产法制建设》等刊物。建成了面向全行业的“中煤信息网”“中国安全生产数字图书馆”和“中国煤炭数字图书馆”。
中国地震台网是由中国地震局监测预报司主管，中国地震台网中心地震台网部负责维护和管理的专注于地震信息及其相关数据产品的发布平台，也是我国防震减灾工作的重要业务枢纽、核心技术平台和基础信息国际交流的重要窗口，设置有地震专题、快捷查询、历史查询、地震活动、关于我们等主要栏目。
中国地震台网中心承担着全国地震监测、地震中短期预测和地震速报；国务院抗震救灾指挥部应急响应和指挥决策技术系统的建设和运行；全国各级地震台网的业务指导和管理；各类地震监测数据的汇集、处理与服务；地震信息网络和通讯服务以及地震科技情报研究与地震科技期刊管理等。
地震预测研究所是直属于中国地震局的我国特殊的社会公益类非营利性科研机构，主要任务是探索地震孕育、发生规律，承担全国中强以上地震的中短期预报、首都圈地区5级以上地震的短临预报及其研究任务；国家防震减灾中心技术系统的建设与运行管理服务任务，为地震预报、地震应急、地震科学研究和防震减灾提供技术支持与数据信息服务。
地震预测研究所以地震孕育、发生过程和预测实践中提出的科学问题为研究对象，依托科学技术进步与创新，依托新构造与地震构造、数字地震学、地震及灾害预测、GPS及空间技术以及地震观测技术等多学科的滲透、融合，推进、发展地震数值预测的理论与方法，逐步集成有特色的基础学科、研究领域和专家群体，通过对地震过程的观测、模拟和预测理论及方法研究，探索地震孕育、发生和发展规律，促进地震科学发展，为地震监测预报和防震减灾服务。
地壳应力研究所位于北京市海淀区西三旗环岛西侧，是中国地震局直属的非营利性公益科研所，也是我国地壳动力学研究的重要基地，以及以地壳动力学、地震前兆观测与研究、地震与地质灾害等有关的基础理论和应用研究为主要任务的综合性研究所，内设办公室、科学技术处、人事教育处、计划财务处、党群工作办公室、纪检监察审计室、离退休干部处、后勤服务中心等机构。
地壳应力研究所下设地壳动力学研究室、地震前兆观测理论与技术研究室、断层力学与形变观测研究室、地壳应力应变与岩石力学研究室、地震监测与预报研究室、综合减灾技术研究室、地震救援技术研究室、地震信息网络研究室研究室、武汉科技创新基地。重点研究领域和方向主要有地壳动力学理论、地壳应力场和形变场、地震构造力学机理、地震预测理论与方法、地震前兆理论和观测技术、大地测量理论与观测技术、重力和固体潮理论与观测、遥感和卫星影像等空间信息技术的应用、地震与地质灾害的机理与监测预警技术。
工程力学研究所是直属于中国地震局的目前国内唯一以地震工程和防灾减灾为主要研究领域的国家公益性科研机构，也是中国地震局地震灾害评估、房屋建筑安全鉴定、地震预警与烈度速报以及强震动观测的技术牵头单位，主要研究领域为地震工程和防灾减灾，主要开展强震动观测、工程地震、结构工程、生命线工程、岩土工程、城市防灾减灾等方面的研究。
工程力学研究所现设有强震动观测、工程地震、结构工程、生命线工程、城市与工程综合防灾、岩土工程、振动测量仪器等七个研究室和恢先地震工程综合实验室；设有所务办公室、科技发展部、人才资源部、计划财务部、党群工作办公室（纪检监察审计室）、离退休工作办公室、北京园区办公室等七个管理部门，以及后勤管理中心、科技杂志社、图书资料与网络中心、试验厂等科研辅助部门。
地质研究所是直属于中国地震局的国家级科研机构，也是一个包括地质、地球物理、地球化学和大地测量学的综合性、多学科的地球科学研究机构，以及国内唯一以研究新构造运动和现今地球动力作用为主的国家级研究所，设有“地震动力学”国家重点实验室和“活动构造与火山”中国地震局重点实验室，拥有设备齐全的科学实验、科学探测系统和大规模并行计算系统。
地质研究所主要从事地震科学和防震减灾领域中的基础理论研究，研究方向涵盖以揭示强震发生地点和强度为主要目标的地震构造环境研究；以探索强震孕育过程和机理为主要目标的地震动力学研究；以发展地震预测新方法为主要目标的对地观测技术综合研究；以认识火山喷发机理和火山灾害预测为主要目标的活动火山研究；以地震灾害综合防御和地震应急理论为主要目标的地震成灾机理和地震地质研究五个方面。同时，研究所还从事新生代构造演化、现代地壳运动、构造物理与高温高压岩石力学、现今地球动力过程、深部地球物理、现代火山作用等地球科学理论的基础研究。
